1、防虫蛀。林木种子在贮藏期，会被多种病虫蛀食，避免的方法是尽量使种子干燥，创造不利害虫生存的环境，可利用晴天中午暴晒种子，消灭害虫。勿使种子接触地面。由于地面湿度大，林木种子直接堆放在地面上会使种子受潮而降低发芽率。因此不管麻袋、布袋及其他容器，都不宜直接堆放在地面上，最好用砖或木板垫高50厘米左右。

2、忌贮种不检查。种子贮藏后会因贮藏不当而使种子霉变，或遭鼠害虫蛀而造成损失，应及时检查并采取相应措施。勿使种子与农药、化肥混存。农药与化肥大多数有挥发性和腐蚀性，如果与种子同室贮藏，会造成种子中毒，降低种子的发芽率。勿使种子混杂。种子收获后要及时贴标签，注明品种和收获日期。

3、勿用塑料袋装种子。塑料袋不透气，在缺氧的条件下，种子进行无氧呼吸，产生大量的有毒物质，能杀死种胚。在塑料袋中，种子呼吸产生的水分和热量散发不出去，容易使种子发热霉变。一般用透气性良好的容器如麻袋、布袋等装种贮藏。

4、贮藏的任务就是延缓种子的衰老过程，最大限度地保持初始活力。初始活力强、成熟度高、机械损伤轻、纯净、无病、无虫、含水量低的种批耐贮藏，寿命较长。干燥过度，种子中类脂物自动氧化所生成的游离基会对大分子造成损伤，不利于贮藏。一般认为影响种子寿命的重要因素是种子含水量和贮藏温度。

多数林木种子适于在干燥环境或瓶、桶等防潮容器中干藏，以免干燥过的种子重新吸湿。含水量按树种和贮藏期限而定，一般为5%～14%，适用温度一般为0～5℃。贮藏前要检验，并按树种和质量情况详细登记，分别存放。定期检测贮藏的环境和种子质量，及时采取措施等。